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大数据助力癌症精准化医疗

点击数:6482015-05-05 09:13:47 

最近几年许多研究机构整理了大范围的癌症组学数据,希望通过这些信息找到驱动癌症发生的分子,并作为药物靶点进行阻断。通过分析了7000多种肿瘤的测序结果,Lopez-Bigas及其同事鉴定除了475个关键的驱动基因,其中有许多是之前没有被报道过,而且对于现有的药物设计具有关键性的启示作用。

作者们收集了Cancer Genome Atlas以及其它研究中获取的测序数据。他们发现鉴定得到的基因中有四分之一属于染色质调控,泛素化降解以及RNA的剪接与成熟作用。至今,很少有这方面的癌症药物靶点被报道出来。这其中有一类包含76个驱动基因的亚群,被称作"主效癌症驱动基因",这些基因的突变在肿瘤细胞中频率非常高,表明这些基因对于患者的健康具有重要的影响。
 
该数据也反映了基因的拷贝数的变化以及基因的融合现象。当基因发生突变后,拷贝数的变化与融合也会伴随发生。90%的肿瘤至少存在上述一种现象。
 
作者之后查阅了这些突变中有哪些已经作为药物靶点被鉴定了出来。结果显示,在475种基因中,有96种得到了前人的注意。
 
通过过滤掉已经被验证无法应用于临床的靶点后,作者针对哪些药物对于患者是有效的做出了总结。电脑模拟的结果表明:仅有5.9%的患者可以进行肿瘤特异性,基因型特异性的药物治疗。将近一半的患者具有ERBB2基因的扩增型突变,针对这一类型的肿瘤由三类药物可以提供治疗。
 
依靠这些手段,有40.2%的患者可以接受至少一类FDA批准的药物治疗。另外有33.1%的患者即使无法利用现有药物进行治疗,也可以选择接受正在临床试验的药物治疗。
 
总之,这一研究为晚期的癌症的精准化治疗提供了新的参考方案。
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